反渗透设计时分段通常是为了提高系统回收率，分级是为了提高产水水质。 

 段数的选择： 

 单段系统：该种形式在海水淡化或废水浓水反渗透中的最为常见，常见回收率在50%左右。对于苦咸水来讲，典型6芯装膜壳  可以达到40~60%的回收率。对于海水淡化，典型7芯装膜壳可以达到45%以内的回收率。

两段系统：苦咸水典型的6芯装膜壳可以达到70~80%的回收率，海水淡化典型7芯装膜壳可以达到50~60%的回收率。

三段系统：苦咸水典型的6芯装膜壳可以达到85~90%的回收率，当然对于以自来水为水源的二级反渗透  采用两段也可以达到。

级数的选择：当常规反渗透的产水水质不达标，对于脱除病毒、细菌和有机物特别重要（超纯水中）及需要的极高的系统可靠性时，需要进行分级。

对于绝大多数系统，做到二级反渗透即可停止。在两级系统中，二级浓水通常回流至一级进水，而且二级反渗透前设置加碱调节pH或除碳器  。两级反渗透之间需设置中间水箱，小系统可以不设置中间水箱，但控制运行联锁需要做好。